上海国际航运研究中心于2008年7月14日正式成立，时任上海市委副书记、市长韩正发来贺信，时任交通运输部副部长徐祖远与时任上海市副市长沈骏共同为“研究中心”成立揭牌。

上海国际航运研究中心由21家单位共同发起，挂靠上海海事大学。第一届理事长单位为中国海运(集团)总公司，第二届理事长单位为上海国际港务(集团)股份有限公司，第三届理事长单位为中国经贸船务有限公司，现任理事长单位为招商轮船（招商局能源运输股份有限公司）。副理事长单位由中国远洋海运集团有限公司、上海国际港务(集团)股份有限公司、上海组合港管委会办公室、上海海事局、上海市教育委员会、上海市交通委员会、上海市虹口区人民政府、武汉新港管理委员会、交通运输部珠江航务管理局、交通运输部科学研究院、交通运输部规划研究院、交通运输部水运科学研究院、中远海运集装箱运输有限公司、招商局港口控股有限公司、上海锦江航运(集团)有限公司、上海航运交易所、中国港口协会、上海船东协会、上海市国际货运代理行业协会、大连商品交易所、上海国际能源交易中心股份有限公司、江苏省港口集团有限公司、世界海事大学、上海海事大学、上海交通大学、宁波大学、上海对外经贸大学等29家单位组成。目前拥有200多家理事单位会员。

上海国际航运研究中心以上海国际航运中心建设为依托，广泛联络国际航运组织、企业和院校，凝聚国内外一流专家，搭建国际航运研究平台。跟踪全球航运发展的新理念、新技术、新趋势和新制度，把握国际航运市场变化的脉搏，为中国航运事业的发展做出贡献。

上海国际航运研究中心是国际航运业发展的研究和咨询机构，为政府和国内外企业与航运机构等提供决策咨询和信息服务。